Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121992.3-201ENST00000606186 346 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP21-3Q3LHN1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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