Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHD9Q3L8U1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHD9Q3L8U1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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