Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 GAPDHP74-202ENST00000632456 782 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms