Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CSPP1Q1MSJ5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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