Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLPPQ16740 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLPPQ16740 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLPPQ16740 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
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