Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FXNQ16595 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FXNQ16595 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FXNQ16595 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FXNQ16595 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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FXNQ16595 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FXNQ16595 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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