Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CARTPTQ16568 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CARTPTQ16568 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms