Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SNAPC1Q16533 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SNAPC1Q16533 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SNAPC1Q16533 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNAPC1Q16533 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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SNAPC1Q16533 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNAPC1Q16533 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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