Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC6Q16204 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC6Q16204 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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