Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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VAMP3Q15836 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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