Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC85BQ15834 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC85BQ15834 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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