Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIP4Q15650 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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