Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms