Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PUM3Q15397 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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