Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE3CQ15386 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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