Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ERV3-1Q14264 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ERV3-1Q14264 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms