Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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