Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAPSNQ13702 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAPSNQ13702 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAPSNQ13702 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAPSNQ13702 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAPSNQ13702 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RAPSNQ13702 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAPSNQ13702 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms