Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1SQ13698 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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