Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4AQ13619 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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