Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms