Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
XRCC4Q13426 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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