Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DUSP4Q13115 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DUSP4Q13115 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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