Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FOXF2Q12947 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms