Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BPTFQ12830 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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