Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TWF1Q12792 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms