Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAPQ12770 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAPQ12770 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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