Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLFN5Q08AF3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms