Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSRP1Q08945 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms