Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CXCL9Q07325 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms