Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABPAQ06546 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms