Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSME1Q06323 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms