Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ERCC6Q03468 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms