Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
IRF9Q00978 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF9Q00978 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms