Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H3F3AP84243 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H3F3AP84243 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H3F3AP84243 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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H3F3AP84243 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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H3F3AP84243 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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H3F3AP84243 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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H3F3AP84243 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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H3F3AP84243 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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