Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IRX1P78414 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
IRX1P78414 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRX1P78414 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms