Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERVK_113P63132 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms