Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AP3M2P53677 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP3M2P53677 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms