Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNQ1P51787 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms