Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSRP3P50461 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms