Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK8P49336 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms