Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1DP48730 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms