Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PREPP48147 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PREPP48147 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PREPP48147 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PREPP48147 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PREPP48147 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PREPP48147 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PREPP48147 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PREPP48147 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PREPP48147 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PREPP48147 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms