Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AFMP43652 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AFMP43652 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AFMP43652 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AFMP43652 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AFMP43652 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AFMP43652 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AFMP43652 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AFMP43652 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AFMP43652 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AFMP43652 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AFMP43652 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms