Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A2P43004 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms