Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASP2P42575 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP2P42575 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms