Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms