Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLD1P28340 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLD1P28340 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLD1P28340 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLD1P28340 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
POLD1P28340 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLD1P28340 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLD1P28340 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLD1P28340 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLD1P28340 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLD1P28340 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLD1P28340 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms