Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSMB4P28070 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms