Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VARSP26640 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VARSP26640 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VARSP26640 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms